公司单方面放假并扣减加班工时，不合法。依据《劳动法》，法定休假日等，用人单位应支付工资，扣减可能侵犯员工权益，造成劳动关系紧张。
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对此情况，员工可与公司协商、向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。选择时应考虑证据充分性、处理效率及个人诉求，以决定最佳途径。
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公司此举不合法。应对方式：1.与公司沟通，要求合理解释并纠正；2.收集证据，如工资条、放假通知等；3.若沟通无果，向劳动监察大队投诉；4.必要时，申请劳动仲裁，维护自身权益。